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CGHnormaliter
DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHnormaliter
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CGHnormaliter。
正常化全息阵列数据与不平衡的畸变。
Bioconductor版本:3.10
归一化和集中化的阵列比较基因组杂交(aCGH)数据。算法使用一个迭代过程的影响,有效地消除了不平衡数字副本。这将导致一个更可靠的评估拷贝数改变(CNAs)。
作者:巴特P.P. van Houte)托马斯·w·Binsl Hannes Hettling
维修工:巴特P.P. van Houte < bvhoute在few.vu.nl >
从内部引用(R,回车引用(“CGHnormaliter”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CGHnormaliter”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CGHnormaliter”)
| R脚本 | CGHnormaliter | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 微阵列,预处理,软件 |
| 版本 | 1.40.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(10.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | CGHcall(> = 2.17.0),CGHbase(> = 1.15.0) |
| 进口 | Biobase,CGHbase,CGHcall、方法、统计跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CGHnormaliter_1.40.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CGHnormaliter_1.40.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | CGHnormaliter_1.40.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CGHnormaliter |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CGHnormaliter |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CGHnormaliter/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
