此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见萤石.
Bioconductor版本:3.10
函数在一组祖先比例上执行CAnD测试。对于一个特定的祖先亚群体,用户将为每个样本和每个感兴趣的染色体或染色体段提供估计的祖先比例。每个染色体的p值以及每次测试的整体CAnD p值将返回。绘图功能也可用。
作者:凯特琳·麦克休,蒂莫西·桑顿
维护者:Caitlin McHugh
引文(从R内,输入引用(“萤石”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CAnD")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“萤石”)
R脚本 | 利用“CAnD”包检测染色体间群体结构的异质性 | |
参考手册 |
biocViews | GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | 方法,ggplot2,重塑 |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | CAnD_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | CAnD_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | CAnD_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAnD |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CAnD |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CAnD/ |
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