BiocStyle

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocStyle

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BiocStyle．

小插图和其他Bioconductor文档的标准样式

Bioconductor版本:3.10

为Bioconductor PDF和HTML文档提供标准格式样式。bob彩票平台包小插图说明使用和功能。

作者:安德烈·奥莱乌奇、马丁·摩根、沃尔夫冈·胡贝尔

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocStyle”)

超文本标记语言	R脚本	创作R Markdown小插图
PDF	R脚本	生物导体乳胶风格2.0
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	2.14.4
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	bookdown，knitr(> = 1.12),rmarkdown(>= 1.2)， stats, utils，yaml，BiocManager
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，htmltools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle/issues
全靠我	curatedBreastData，cytofWorkflow，methylationArrayAnalysis，org.Mxanthus.db，rnaseqGene
进口我	abseqR，ASpli，BiocWorkflowTools，BPRMeth，BubbleTree，chimeraviz，指南针，德科，DiscoRhythm，geneXtendeR，梅丽莎，PathoStat，PhyloProfile，regionReport，Rmmquant，Rqc，scTensor，scTGIF，srnadiff
建议我	ABAData，ABAEnrichment，王牌，ADAMgui，适应，AffiXcan，affycoretools，AHEnsDbs，ALDEx2，alevinQC，AllelicImbalance，allenpvc，AMOUNTAIN，amplican，AneuFinder，微生物，注释，AnnotationDbi，AnnotationFilter，AnnotationForge，AnnotationHub，AnnotationHubData，annotatr，anota2seq，APAlyzer，arrayQualityMetrics，数组，artMS，ASGSCA，亚瑟士，ASICSdata，AssessORF，AssessORFData，分配，ATACseqQC，atSNP，AUCell，BaalChIP，培根，bamsignals，强盗，basecallQC，基础知识，后面;，BayesPeak，bayNorm，baySeq，beachmat，beadarray，BeadDataPackR，BEARscc，BEclear，benchmarkfdrData2019，BgeeDB，bigmelon，bigmemoryExtras，bioassayR，bioCancer，BiocCheck，BiocFileCache，BiocMetaWorkflow，BiocNeighbors，BiocOncoTK，BioCor，BiocParallel，BiocPkgTools，BiocSet，BiocSingular，BiocSklearn，biomaRt，biomformat，BioMM，biosigner，biotmle，BitSeq，blacksheepr，blima，blimaTestingData，BloodCancerMultiOmics2017，bnbc，bodymapRat，brainflowprobes，分歧点，breakpointR，breakpointRdata，brendaDb，BridgeDbR，BrowserViz，bsseq，BUMHMM，BUScorrect，BUSpaRse，咖啡馆，CAGEfightR，篮球选手，CAGEWorkflow，CAMTHC，CancerInSilico，萤石，红衣主教，CardinalWorkflows，催化剂，cbaf，ccfindR，ccrepe，celda，cellbaseR，CellBench，cellity，CellMapper，CellMapperData，CellMixS，cellTree，CexoR，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，芝加哥，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPexoQual，ChIPpeakAnno，ChIPQC，chipseqDB，chipseqDBData，ChIPSeqSpike，chromstaR，chromswitch，ClassifyR，cleanUpdTSeq，切肉刀，限幅器，CLLmethylation，clusterExperiment，clusterSeq，ClusterSignificance，cn，CNVRanger，可可，CoGAPS，彗星，compcodeR，承认，consensusOV，consensusSeekeR，contiBAIT，conumee，CopyhelpeR，CopyNeutralIMA，CopyNumberPlots，文案，警戒线，CoRegNet，COSMIC.67，cosmiq，CountClust，covRNA，cpvSNP，CRISPRseek，CrispRVariants，csaw，csawUsersGuide，CTDquerier，ctsGE，curatedBladderData，curatedCRCData，curatedMetagenomicData，curatedOvarianData，curatedTCGAData，CVE，cydar，cytofast，dada2，dagLogo，DaMiRseq，DAPAR，dcanr，DChIPRep，ddPCRclust，debCAM，decompTumor2Sig，decontam，反编排，DEGreport，DelayedArray，DelayedMatrixStats，部，服饰，depmap，DEqMS，derfinder，derfinderHelper，derfinderPlot，DEScan2，DEWSeq，DEXSeq，DiffBind，diffcyt，diffuStats，不和谐的，DmelSGI，dmrseq，DNABarcodeCompatibility，DNABarcodes，doppelgangR，Doscheda，定量给料器，drawProteins，DRIMSeq，DropletUtils，dSimer，DSS，DuoClustering2018，dupRadar，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，EGSEA，EGSEA123，eiR，埃尔默，ELMER.data，EmpiricalBrownsMethod，EnrichmentBrowser，ensembldb，EpiDISH，epivizr，epivizrChart，epivizrData，epivizrServer，epivizrStandalone，eQTL，erma，ERSSA，EuPathDB，evaluomeR，EventPointer，ExperimentHub，ExperimentHubData，ExpressionNormalizationWorkflow，FamAgg，FastqCleaner，fCCAC，fCI，fcScan，小伙子，FindMyFriends，flowcatchR，flowMap，FlowSOM，flowSpecs，flowSpy，fmcsR，FourCSeq，furrowSeg，GA4GHclient，GA4GHshiny，空对空导弹，gcapc，GDSArray，genbankr，GeneAccord，genefilter，GeneNetworkBuilder，GeneOverlap，geneplast，generegulation，《创世纪》，GeneStructureTools，GenoGAM，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicDataCommons，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicInteractions，GenomicRanges，GenomicScores，GenomicState，GenomicTuples，genoset，GenVisR，GeuvadisTranscriptExpr，ggbio，GladiaTOX，Glimma，glmSparseNet，GMRP，GOexpress，GOfuncR，还装有，goSTAG，gpart软件，gpuMagic，gQTLBase，gQTLstats，葡萄，石墨，GreyListChIP，GRmetrics，groHMM，GSAR，GSE62944，GSEABase，GSEABenchmarkeR，GUIDEseq，Gviz，gwasurvivr，哈曼，HarmanData，HCABrowser，HCAData，HCAExplorer，HD2013SGI，HDCytoData，HDF5Array，HelloRanges，HelloRangesData，HiCBricks，highthroughputassays，Hiiragi2013，希尔达，hipathia，HIREewas，HiTC，HMP16SData，HMP2Data，HPAanalyze，hpAnnot，hpar，HTSFilter，HumanAffyData，HumanTranscriptomeCompendium，理想的，iGC，IgGeneUsage，igvR，IHW，IHWpaper，illuminaio，imageHTS，ima，Imetagene，immunoClust，infercnv，InPAS，检查，InTAD，InteractionSet，InterMineR，电离，IRanges，iSEE，isomiRs，iva，JctSeqData，JunctionSeq，karyoploteR，kissDE，ldblock，liftOver，LinkHD，Linnorm，lipidr，loci2path，Logolas，萝拉，LoomExperiment，LowMACA，lpsymphony，LRBaseDbi，M3D，MACPET，maEndToEnd，mAPKL，微波激射器，桅杆，MatrixRider，事，MaxContrastProjection，工商管理硕士，mbkmeans，mbt，MCbiclust，mCSEA，mCSEAdata，mdgsa，餐，MEDIPS，墨西拿，MetaboSignal，metagene，metagene2，metagenomeFeatures，metavizr，methimpute，methInheritSim，MethPed，MethylAid，MethylAidData，methylCC，methylInheritance，MethylMix，methyvim，methyvimData，MetNet，mfa，微生物组，mimager，minfi，minionSummaryData，米拉，miRcomp，miRmine，miRSM，miRspongeR，missMethyl，missRows，mixOmics，mlm4omics，MLSeq，MMAPPR2，MMAPPR2data，MMDiff2，MMUPHin，这种款式，Modstrings，mogsa，MoonlightR，MOSim，motifbreakR，motifStack，MouseGastrulationData，mpra，MSMB，MSnbase，MSnID，msPurity，msqc1，MSstats，MSstatsBioData，MSstatsSampleSize，MSstatsTMT，MTseeker，MultiAssayExperiment，MultiDataSet，multiHiCcompare，multiMiR，马斯喀特，muscData，MutationalPatterns，MWASTools，mygene，myvariant，mzR，NADfinder，NanoStringDiff，NanoStringQCPro，纳米管，NarrowPeaks，ncGTW，ndexr，NestLink，netbiov，nethet，NetPathMiner，netprioR，netReg，netSmooth，ngsReports，nondetects，NormalyzerDE，normr，npGSEA，nucleoSim，诊断，益生元，omicade4，omicRexposome，OmicsMarkeR，omicsPrint，OmnipathR，奥纳西斯，OnassisJavaLibs，OncoScore，OncoSimulR，ontoProc，OPWeight，ORFik，Organism.dplyr，Oscope，先驱者，OVESEG，PAA，PAIRADISE，PANTHER.db，PanVizGenerator，parathyroidSE，parglms，pasilla，PasillaTranscriptExpr，Path2PPI，paxtoolsr，Pbase，pcaExplorer，PCAN，PCHiCdata，peakPantheR，PepsNMR，PepsNMRData，perturbatr，PGA，phantasus，phenopath，philr，phyloseq，π，钢琴，Pigengene，plethy，plotGrouper，plyranges，Polyfit，PoTRA，powerTCR，pqsfinder，婴儿车，PrecisionTrialDrawer，王子，profileplyr，profileScoreDist，projectR，pRoloc，pRolocGUI，适当的，Prostar，蛋白质组学，ProteomicsAnnotationHubData，ProteoMM，proteoQC，PSEA，PureCN，PWMEnrich，qcmetrics，QDNAseq，qpgraph，qsea，qsmooth，QSutils，Qtlizer，quantro，QuasR，R3CPET，RaggedExperiment，雨，ramwas，RandomWalkRestartMH，rat2302frmavecs，Rbowtie，Rcade，rcellminer，rcellminerData，rCGH，RcisTarget，Rcwl，RcwlPipelines，RCy3，RCyjs，rDGIdb，ReactomePA，重新计票，recountWorkflow，收回，红色的，RefNet，地区，regsplice，ReQON，restfulSE，rexposome，RforProteomics，rfPred，RGMQL，RGMQLlib，RGraph2js，RGSEA，rhdf5，rhdf5client，Rhdf5lib，Rhisat2，Rhtslib，RiboProfiling，riboSeqR，河，RJMCMCNucleosomes，RNAmodR，RNAmodR。AlkAnilineSeq，RNAmodR。数据，RNAmodR。毫升，RNAmodR。RiboMethSeq，RNAprobR，RNAseq123，rnaseqcomp，RnaSeqSampleSize，RnaSeqSampleSizeData，Rnits，的方式，ropls，rpx，rqt，Rsamtools，rScudo，RTCGAToolbox，研制，RTNduals，RTNsurvival，RUVcorr，RUVSeq，旅游房车，rWikiPathways，S4Vectors，samExploreR，sampleClassifier，sampleClassifierData，sangerseqR，sapFinder，嘘，scDblFinder，scDD，scds，SCLCBam，scMerge，SCnorm，司康饼，scoreInvHap，scPCA，食物，scRNAseq，颈背，segmentSeq，seqCAT，seqPattern，seqplots，seqsetvis，SeqSQC，测序，SeqVarTools，芝麻，SEtools，sevenC，SGSeq，SharedObject，shinyMethyl，ShortRead，SIAMCAT，SigCheck，SigFuge，signatureSearch，印，SigsPack，SIMD，similaRpeak，SIMLR，simpleSingleCell，simulatorZ，sincell，Single.mTEC.Transcriptomes，SingleCellExperiment，singleCellTK，单，SingscoreAMLMutations，sitePath，弹弓，紧身的，SMAD，SNPediaR，SNPhood，SNPhoodData，soGGi，寄居，sparseDOSSA，sparsenetgls，SparseSignatures，SpatialCPie，specL，SpectralTAD，SpidermiR，飞溅，分裂，sRACIPE，SSPA，经验丰富的人，斯坦，StarBioTrek，STATegRa，statTarget，strandCheckR，Structstrings，SubCellBarCode，SummarizedBenchmark，SummarizedExperiment，股东价值分析，SVAPLSseq，swfdr，switchde，synapter，systemPipeR，systemPipeRdata，TabulaMurisData，TargetSearch，鞑靼，TCGAbiolinks，TCGAbiolinksGUI，TCGAbiolinksGUI.data，TCGAutils，TENxBrainData，TENxBUSData，TENxPBMCData，TFARM，TFBSTools，TFHAZ，TFutils，tigre，TimerQuant，tissueTreg，TMixClust，烤面包，ToPASeq，topdownr，泛太平洋伙伴关系，tracktables，trackViewer，transcriptogramer，transcriptR，tra利用，TreeSummarizedExperiment，时尚的，tRNA，tRNAdbImport，tRNAscanImport，TRONCO，TTMap，TurboNorm，TVTB，twoddpcr，Ularcirc，UniProt.ws，variancePartition，VariantAnnotation，VariantFiltering，变体，VariantToolsData，VCFArray，vidger，ViSEAGO，vsn，wavClusteR，XBSeq，xcms，Xeva，山药，YAPSA，yriMulti，zebrafishRNASeq，zinbwave
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocStyle_2.14.4.tar.gz
Windows二进制	BiocStyle_2.14.4.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BiocStyle_2.14.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocStyle
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocStyle
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocStyle/
软件包下载报告	下载数据