BiocParallel

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocParallel

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BiocParallel．

用于并行评估的生物导体设备

Bioconductor版本:3.10

此包提供了用于并行计算的修改版本和新颖函数实现，为与Bioconductor对象一起使用而定制。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]， Martin Morgan [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Michel Lang [aut]， Ryan Thompson [aut]， Nitesh Turaga [aut]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BiocParallel")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocParallel”)

PDF	R脚本	1.BiocParallel简介
PDF	R脚本	2.BatchtoolsParam简介
PDF	R脚本	3.错误，日志和调试
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	1.20.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	Gpl-2 | gpl-3
取决于	方法
进口	属性,跑龙套,futile.logger平行,雪
链接	黑洞
建议	BiocGenerics、工具、foreach，BatchJobs，BBmisc，doParallel，Rmpi，GenomicRanges，RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，VariantAnnotation，Rsamtools，GenomicAlignments，ShortRead，codetools，RUnit，BiocStyle，knitr，batchtools，data.table
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/issues
全靠我	培根，BEclear，红衣主教，ClassifyR，clusterSeq，consensusSeekeR，文案，cydar，德科，DelayedArray，DEWSeq，DEXSeq，DMCFB，DMCHMM，doppelgangR，GenomicFiles，hiReadsProcessor，检查，事，工商管理硕士，metagene，metagene2，ncGTW，Oscope，先驱者，PCAN，pRoloc，Rqc，测序，ShortRead，SigCheck，STROMA4，SummarizedBenchmark，股东价值分析，xcms
进口我	abseqR，AffiXcan，ALDEx2，AlphaBeta，阿尔卑斯山脉，amplican，亚瑟士，ASpediaFI，atSNP，强盗，后面;，bayNorm，BiocNeighbors，BioCor，BiocSingular，BioMM，BioNetStat，biotmle，brendaDb，bsseq，CAGEfightR，篮球选手，CAMTHC，cellbaseR，CellBench，CellMixS，ChIPexoQual，ChIPQC，chromswitch，chromVAR，CNVRanger，CoGAPS，consensusDE，contiBAIT，coseq，cpvSNP，CRISPRseek，CrispRVariants，csaw，dcGSA，debCAM，DEComplexDisease，DelayedMatrixStats，derfinder，DEScan2，DESeq2，DEsingle，DiffBind，dmrseq，剂量，DRIMSeq，DropletUtils，easyRNASeq，EMDomics，erma，ERSSA，fgsea，FindMyFriends，flowcatchR，flowSpecs，GDCRNATools，GenoGAM，GenomicAlignments，genotypeeval，gmapR，gscreend，GSEABenchmarkeR，GUIDEseq，h5vc，HiCBricks，HiCcompare，HTSeqGenie，HTSFilter，iasva，icetea，理想的，IHWpaper，ima，ImpulseDE2，InPAS，感兴趣，电离，首次公开募股，iva，JunctionSeq，KinSwingR，LineagePulse，loci2path，LowMACA，MACPET，MCbiclust，metabomxtr，MethCP，MethylAid，methylGSA，methylInheritance，methyvim，MetNet，MIGSA，minfi，MMAPPR2，motifbreakR，MPRAnalyze，MSnbase，MSstatsSampleSize，multiHiCcompare，马斯喀特，NBAMSeq，NBSplice，OmicsLonDA，ORFik，OVESEG，PAIRADISE，Pbase，PCAtools，PowerExplorer，婴儿车，PrecisionTrialDrawer，proFIA，profileplyr，qpgraph，qsea，QuasR，Rcwl，重新计票，REMP，RJMCMCNucleosomes，RNAmodR，Rsamtools，RUVcorr，嘘，scDblFinder，scDD，scde，scMerge，SCnorm，司康饼，scoreInvHap，scPCA，食物，scRecover，颈背，芝麻，sigFeature，signatureSearch，单，singscore，SNPhood，soGGi，SpectralTAD，飞溅，SplicingGraphs，srnadiff，TarSeqQC，TFBSTools，TMixClust，tradeSeq，trena，时尚的，TSRchitect，TVTB，TxRegInfra，variancePartition，VariantFiltering，VariantTools，waddR，zinbwave
建议我	CAGEWorkflow，嵌合体，curatedMetagenomicData，HDF5Array，MethylAidData，netSmooth，omicsPrint，PureCN，RcisTarget，scGPS，SeqArray，systemPipeR，TENxBrainData，TENxPBMCData，TFutils，tofsims，universalmotif
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocParallel_1.20.1.tar.gz
Windows二进制	BiocParallel_1.20.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BiocParallel_1.20.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocParallel
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocParallel
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocParallel/
软件包下载报告	下载数据