BioNetStat

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioNetStat

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BioNetStat。

生物网络分析

Bioconductor版本:3.10

一个包执行微分网络分析,微分节点分析(微分coexpression分析),网络和代谢途径的观点。参考论文已经有了在https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00594。

作者:维尼Jardim Suzana桑托斯,安德烈Fujita,马科斯Buckeridge

维护人员:维尼Jardim < viniciusjc gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BioNetStat”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BioNetStat”)

HTML		1。行命令教程
HTML		2。接口教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,代谢组学,微阵列,网络,NetworkInference,通路,蛋白质组学,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(2年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.5),闪亮的,igraph,shinyBS,pathview
进口	BiocParallel,RJSONIO,晶须,yaml,pheatmap,ggplot2,plyr,跑龙套,统计数据,RColorBrewer,Hmisc,心理,knitr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat
BugReports	http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BioNetStat_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	BioNetStat_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	BioNetStat_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNetStat
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioNetStat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioNetStat/
包下载报告	下载数据