生命网络

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioNet

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅生命网络。

例程,生物网络的功能分析

Bioconductor版本:3.10

这个包提供了功能集成的分析蛋白质相互作用网络和功能模块的检测。不同的数据集可以被集成到网络分配假定值的统计测试网络的节点。例如假定值从微分表达式获得的基因从一个Affymetrix数组分配给网络的节点。通过拟合beta-uniform混合模型假定值和计算分数,总分的网络可以计算区域和一个整数线性规划算法确定最大得分子网。

作者:马库斯>,达妮埃拉Beisser

维护人员:马库斯> <马库斯。在biozentrum.uni-wuerzburg.de > >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“生命网络”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“生命网络”)

PDF	R脚本	生命网络教程
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,GraphAndNetwork,微阵列,网络,NetworkEnrichment,软件
版本	1.46.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(9.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0),图,RBGL
进口	igraph(> = 1.0.1),AnnotationDbi,Biobase
链接
建议	rgl,嫁祸于,DLBCL,genefilter,xtable,所有,limma,hgu95av2.db,XML
SystemRequirements
增强了
URL	http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
取决于我
进口我	HTSanalyzeR,击杀
建议我	圣诞老人
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BioNet_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	BioNet_1.46.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	BioNet_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/生命网络
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioNet/
包下载报告	下载数据