BEclear

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEclear

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BEclear．

DNA甲基化数据中的批效应修正

Bioconductor版本:3.10

提供检测和纠正DNA甲基化数据中的批量效应的函数。核心函数基于潜在因子模型，也可以用于预测任何其他包含实数的矩阵中的缺失值。

作者:David Rasp [aut, cre]，马库斯·梅尔[aut]，鲁斯兰·阿库连科[aut]

维护者:David Rasp < David .j。拉斯普在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" clear")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BEclear”)

超文本标记语言	R脚本	BEclear教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，DNAMethylation，预处理，软件，StatisticalMethod
版本	2.2.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	BiocParallel(> = 1.14.2)
进口	futile.logger，Rdpack，矩阵，data.table(> = 1.11.8),Rcpp，离群值，abind，统计，图形，utils，方法
链接	Rcpp
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，老鸨
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/David-J-R/BEclear
BugReports	https://github.com/David-J-R/BEclear/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BEclear_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	BEclear_2.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	BEclear_2.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BEclear
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BEclear
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BEclear/
软件包下载报告	下载数据