强盗

DOI:10.18129 / B9.bioc.BANDITS

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅强盗。

土匪:贝叶斯分析的微分拼接

Bioconductor版本:3.10

土匪是一个贝叶斯分层模型微分剪接基因检测和记录,通过微分成绩单使用(差),在两个或两个以上的条件。方法使用贝叶斯层次框架,它允许样本Dirichlet-Multinomial模型中特定的比例,和样品的分配记录片段。参数推断通过马尔可夫链蒙特卡罗(密度)技术和系统测试执行通过多元瓦尔德测试的后验密度平均相对大量的记录。

作者:西蒙Tiberi (aut (cre),马克·d·罗宾逊(aut)。

维护人员:西蒙Tiberi <西蒙。在uzh.ch tiberi >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“土匪”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“土匪”)

HTML	R脚本	土匪:贝叶斯分析的微分拼接
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,贝叶斯,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,遗传学,MultipleComparison,RNASeq,测序,软件,转录,WorkflowStep
版本	1.2.3
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	Rcpp,doRNG,质量,data.table,R.utils,doParallel平行,foreach、方法、数据、图形、ggplot2,DRIMSeq,BiocParallel
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	knitr,rmarkdown,testthat,tximport,BiocStyle,GenomicFeatures,Biostrings
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/SimoneTiberi/BANDITS
BugReports	https://github.com/SimoneTiberi/BANDITS/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BANDITS_1.2.3.tar.gz
Windows二进制	BANDITS_1.2.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	BANDITS_1.2.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BANDITS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/强盗
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BANDITS/
包下载报告	下载数据