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ArrayExpress
DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpress
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ArrayExpress。
访问ArrayExpress微阵列数据库在EBI和构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet
Bioconductor版本:3.10
访问在EBI和构建Bioconductor ArrayExpress库数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet
作者:奥黛丽•考夫曼易卜拉欣伊玛目,迈克尔·舒伯特
维护人员:哈姆·穆罕默德在ebi.ac.uk > <哈姆
从内部引用(R,回车引用(“ArrayExpress”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ArrayExpress”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ArrayExpress”)
| R脚本 | ArrayExpress:导入和R ArrayExpress数据集转换成对象 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DataImport,微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel |
| 版本 | 1.46.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.3 (r - 2.8)(11.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.9.0),Biobase(> =测试盒框) |
| 进口 | XML,益生元,limma |
| 链接 | |
| 建议 | affy |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | DrugVsDisease,maEndToEnd |
| 进口我 | |
| 建议我 | gCMAPWeb,Hiiragi2013 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ArrayExpress_1.46.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ArrayExpress_1.46.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ArrayExpress_1.46.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpress |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ArrayExpress |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpress/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
