AnnotationHubData

DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationHubData

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见AnnotationHubData．

将公共数据资源转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:3.10

这些菜谱将各种各样和越来越多的公共生物信息学数据集转换为易于使用的标准Bioconductor数据结构。

作者:Martin Morgan [ctb]， Marc Carlson [ctb]， Dan Tenenbaum [ctb]， Sonali Arora [ctb]， Paul Shannon [ctb]， Lori Shepherd [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("AnnotationHubData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AnnotationHubData”)

超文本标记语言		创建一个AnnotationHub包
超文本标记语言		AnnotationHubData简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.2.2)，方法，utils，S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges，AnnotationHub(> = 2.15.15)
进口	GenomicFeatures，Rsamtools，rtracklayer，BiocGenerics，jsonlite，BiocManager，biocViews，AnnotationDbi，Biobase，Biostrings，DBI，GenomeInfoDb(> = 1.15.4),OrganismDbi，RSQLite，rBiopaxParser，AnnotationForge，futile.logger1.3.0(> =版本),XML，RCurl
链接
建议	RUnit，knitr，BiocStyle，grasp2db，GenomeInfoDbData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	ExperimentHubData，ProteomicsAnnotationHubData
进口我	AHEnsDbs，EuPathDB
建议我	GenomicState
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AnnotationHubData_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	AnnotationHubData_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	AnnotationHubData_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AnnotationHubData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationHubData/
软件包下载报告	下载数据