AllelicImbalance

DOI:10.18129 / B9.bioc.AllelicImbalance

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见AllelicImbalance．

研究等位基因特异性表达

Bioconductor版本:3.10

为使用RNA-seq数据进行等位基因特异性表达研究提供了一个框架。

作者:Jesper R Gadin, Lasse Folkersen

维护者:Jesper R Gadin

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" allelic失衡")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AllelicImbalance”)

PDF	R脚本	AllelicImbalance装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学，基础设施，测序，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.2.0)，网格，GenomicRanges(> = 1.31.8),SummarizedExperiment(> = 0.2.0),GenomicAlignments(> = 1.15.6)
进口	方法,BiocGenerics，AnnotationDbi，BSgenome(> = 1.47.3),VariantAnnotation(> = 1.25.11),Biostrings(> = 2.47.6),S4Vectors(> = 0.17.25),IRanges(> = 2.13.12),Rsamtools(> = 1.99.3),GenomicFeatures(> = 1.31.3),Gviz，晶格，latticeExtra，gridExtra，seqinr，GenomeInfoDb，nlme
链接
建议	testthat，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance
BugReports	https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AllelicImbalance_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	AllelicImbalance_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	AllelicImbalance_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AllelicImbalance
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ allelic失衡
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AllelicImbalance/
软件包下载报告	下载数据