此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见AffiXcan.
Bioconductor版本:3.10
利用基于总结合亲和力(TBA)的方法,为个体样本中的一组基因输入一个GReX(基因调控表达)。输入GReX的统计模型可以用一个已知真实总表达式值的训练数据集进行训练。
作者:Alessandro Lussana [aut, cre]
维护者:Alessandro Lussana < Alessandro。Lussana在protonmail.com>
引文(从R内,输入引用(“AffiXcan”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("AffiXcan")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AffiXcan”)
超文本标记语言 | R脚本 | AffiXcan |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DimensionReduction,GeneExpression,GeneRegulation,PrincipalComponent,回归,软件,转录 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6),SummarizedExperiment |
进口 | MultiAssayExperiment,BiocParallel,蜡笔 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | AffiXcan_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | AffiXcan_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | AffiXcan_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffiXcan |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AffiXcan |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AffiXcan/ |
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