ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ASpli．

利用RNA-Seq分析替代剪接

Bioconductor版本:3.10

使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。

作者:Estefania Mancini, Javier Iserte, Marcelo Yanovsky和Ariel Chernomoretz

维护:Estefania Mancini

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ASpli")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ASpli”)

PDF	R脚本	基于ASpli的可选拼接分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL
取决于	方法，grDevices, stats, utils, parallel，刨边机
进口	GenomicRanges，GenomicFeatures，BiocGenerics，IRanges，GenomicAlignments，Gviz，S4Vectors，AnnotationDbi，Rsamtools，BiocStyle
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ASpli_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	ASpli_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ASpli_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpli
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
软件包下载报告	下载数据