Acme

doi:10.18129/b9.bioc.acme

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Acme

计算微阵列富集的算法(ACME)

生物导体版本:3.10

ACME(用于计算微阵列富集的算法)是一组用于分析平铺阵列芯片/芯片,DNase超敏反应或其他导致基因组区域显示“富集”区域的工具。它不依赖特定的数组技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),但非常通用(可以应用于导致富集区域的实验中),并且对数组噪声或正常化方法非常不敏感。它也非常快,可以通过足够的内存轻松地应用于全基因组瓷砖阵列实验。

作者:Sean Davis

维护者:sean davis

引用(从r内,输入引用(“ Acme”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ acme”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Acme”)

PDF R脚本 Acme
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,正常化,,,,软件,,,,技术
版本 2.42.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(13年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.10),生物酶(> = 2.5.5),方法,生物基因
进口 图形,统计
链接
建议
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增强
URL http://watson.nci.nih.gov/~sdavis
取决于我
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构建报告

包装档案

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源包 acme_2.42.0.tar.gz
Windows二进制 acme_2.42.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) acme_2.42.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/acme
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/acme
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/acme/
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