此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Acme。
生物导体版本:3.10
ACME(用于计算微阵列富集的算法)是一组用于分析平铺阵列芯片/芯片,DNase超敏反应或其他导致基因组区域显示“富集”区域的工具。它不依赖特定的数组技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),但非常通用(可以应用于导致富集区域的实验中),并且对数组噪声或正常化方法非常不敏感。它也非常快,可以通过足够的内存轻松地应用于全基因组瓷砖阵列实验。
作者:Sean Davis
维护者:sean davis
引用(从r内,输入引用(“ Acme”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ acme”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Acme”)
R脚本 | Acme | |
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,正常化,,,,软件,,,,技术 |
版本 | 2.42.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(13年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.10),生物酶(> = 2.5.5),方法,生物基因 |
进口 | 图形,统计 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://watson.nci.nih.gov/~sdavis |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 奥利戈 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | acme_2.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | acme_2.42.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | acme_2.42.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/acme |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/acme |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/acme/ |
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