王牌
DOI:10.18129 / B9.bioc.ACE
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见王牌．
低覆盖率全基因组测序的绝对拷贝数估计
Bioconductor版本:3.10
利用分段拷贝数数据估计肿瘤细胞百分比，并产生显示绝对拷贝数的拷贝数图。
作者:Jos B Poell
维护者:Jos B Poell
引文(从R内，输入引用(“王牌”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“王牌”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | ACE装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CopyNumberVariation，报道，DNASeq，测序，软件，可视化，WholeGenome |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.4) |
| 进口 | Biobase，QDNAseq，ggplot2，网格，统计，utils，方法，grDevices，GenomicRanges |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/tgac-vumc/ACE |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ACE_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ACE_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ACE_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACE |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ACE |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ACE/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
