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此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本，请参见XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38．

智人的额外SNP位点(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:3.1

从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人额外SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建，包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p2(一个补丁版本的GRCh38，不改变染色体1-22,X, Y, MT)。而snplcs . hsapens . dbsnp144。GRCh38包只包含“snp”类的分子变异，该包包含其他类的分子变异(in-del、杂合子、微卫星、命名位点、无变异、混合和多核苷酸多态性)。

作者:Herve Pages

维护人员:H. Pages

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" xtrnsplocs . hsapiens . dbsnp144 . grch38 ")

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，XtraSNPlocs
版本	0.99.12
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，BSgenome
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
软件包下载报告	下载数据