要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ txdb.hsapiens.ucsc.ucsc.hg19.nown nownergene”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅txdb.hsapiens.ucsc.hg19。
生物导体版本:3.1
通过将其公开为TXDB对象,暴露了从UCSC生成的注释数据库
作者:马克·卡尔森
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ txdb.hsapiens.ucsc.ucsc.hg19.nown nownergene”)
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,TXDB |
版本 | 3.1.2 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | GenomicFeatures(> = 1.19.32) |
进口 | GenomicFeatures,,,,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | CGDV17,,,,嵌合体,,,,FDB.Infinium -Methylation.hg19,,,,funcisnp,,,,同性恋 |
进口我 | Chipseeker |
建议我 | 等位基因平衡,,,,AnnotationDbi,,,,Beadarray,,,,Biomvrcns,,,,Biovizbase,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Bumphunter,,,,Chippeakanno,,,,chipqc,,,,CPVSNP,,,,CRISPRSEEK,,,,德芬德,,,,derfinderplot,,,,量规,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,genoview,,,,GGBIO,,,,GMAPR,,,,GoogleGenomics,,,,grohmm,,,,htseqgenie,,,,inpas,,,,甲基分析,,,,R3CPET,,,,地区报告,,,,rtracklayer,,,,sgseq,,,,sigfuge,,,,剪接图,,,,TrackViewer,,,,变体,,,,变体滤波器 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene_3.1.2.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene/ |
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