要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包是Biocumonds 3.1版;对于稳定的最新版本版本,请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.。
Bioconductor版本:3.1
从NCBI DBSNP构建144提取的SNP位置和同性恋的等位基因144.用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建,并包含映射到参考基因组GCH37.P13的SNP。警告:请注意,GRCH37.P13 Genome是GRCH37的修补版本,但贴片不会改变染色体1-22,x,y,mt。GRCH37本身与来自UCSC *的HG19基因组相同,除了线粒体染色体之外。因此,该包装中的SNP可以在BSGenome.hsapiens.ucsc.hg19中“注入”,它们将在正确的位置降落,但这种注射将排除CHRM(即,没有任何内容注入该序列)。
作者:Herve页面
维护者:H.页面
引文(从R内,输入引文(“snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”)
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | annotationdata.那遗传学那homo_sapiens.那snplocs. |
版本 | 0.99.11 |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.10),bsgenome. |
进口 | 方法,Utils,生物根系那S4Vectors.那绞喉那Genomeinfodb.那Genomicranges.那bsgenome. |
链接到 | |
建议 | 生物仪器那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37. |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37_0.99.11.tar.gz. |
Windows二进制文件 | |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
Mac OS x 10.9(mavericks) | |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37/ |
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