要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.

此包是Biocumonds 3.1版;对于稳定的最新版本版本,请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.

Homo Sapiens的SNP位置(DBSNP Build 144)

Bioconductor版本:3.1

从NCBI DBSNP构建144提取的SNP位置和同性恋的等位基因144.用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建,并包含映射到参考基因组GCH37.P13的SNP。警告:请注意,GRCH37.P13 Genome是GRCH37的修补版本,但贴片不会改变染色体1-22,x,y,mt。GRCH37本身与来自UCSC *的HG19基因组相同,除了线粒体染色体之外。因此,该包装中的SNP可以在BSGenome.hsapiens.ucsc.hg19中“注入”,它们将在正确的位置降落,但这种注射将排除CHRM(即,没有任何内容注入该序列)。

作者:Herve页面

维护者:H.页面

引文(从R内,输入引文(“snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37”)

文件

PDF. 参考手册

细节

Biocviews. annotationdata.遗传学homo_sapiens.snplocs.
版本 0.99.11
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 2.10),bsgenome.
进口 方法,Utils,生物根系S4Vectors.绞喉Genomeinfodb.Genomicranges.bsgenome.
链接到
建议 生物仪器bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我 xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37_0.99.11.tar.gz.
Windows二进制文件
Mac OS x 10.6(雪豹)
Mac OS x 10.9(mavericks)
包短网址 http://biocidodder.org/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37/
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