### R代码来自Vignette Source'insilicodb2.rnw'###################################################################################Insilicologin(“ rpackage_tester@insilicodb.com”,“ 5C4D0B231E5CBA4A0BC54783B385CC9A”);eset = getDatasetinfo(“ GSE781”,“ GPL96”);打印(eset);##我们检查平台GPL97 Norms = C(“ FRMA”,“ ORICANT”)输出= sapply(norms,function(n){tryCatch({eset <-getDatasetInfo)(getDatasetInfo(“ GSE781”,“ GSE781”,,get getDataSetinfo(“ GESE)”,“ gpl97”,norm = n); eset $ norm;},error = function(e){“ novabiail”});});打印(输出);#因此,我们可以得出结论,平台GPL97上的系列GSE781不支持FRMA ############################################################# ###代码块编号2:getPlatformlist ############################################################打印(平台);frmaplatforms = getPlatFormList(norm =“ frma”); print(FRMAplatforms); ################################################### ### code chunk number 3: curated_dataset ################################################### # without curated data eset = getDataset("GSE4635", "GPL96", format = "ESET"); # with curated data cureset = getDataset("GSE4635", "GPL96", format = "CURESET", curation = 9016); print(phenoData(eset)); print(phenoData(cureset)); ################################################### ### code chunk number 4: getCurationInfo ################################################### default = getDefaultCuration("GSE4635"); print(default); getCurationInfo("GSE4635"); ################################################### ### code chunk number 5: SCAN ################################################### scan = getDataset("GSE7670", "GPL96", norm = "SCAN", features = "gene"); # example of values in SCAN normalization print(exprs(scan)[1:10, 1:5]); ################################################### ### code chunk number 6: inSilicoDb2.Rnw:132-133 ################################################### sessionInfo()