要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tweeDEseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

tweeDEseq

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见tweeDEseq

使用Poisson-Tweedie分布族的RNA-seq数据分析

Bioconductor版本:3.1

利用Poisson-Tweedie分布族对RNA-seq进行差异表达分析。

作者:Juan R Gonzalez 和Mikel Esnaola (由Robert Castelo贡献< Robert。Castelo在upf.edu>)

维护者:Juan R Gonzalez

引文(从R内,输入引用(“tweeDEseq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tweeDEseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“tweeDEseq”)

PDF R脚本 tweeDEseq:使用Poisson-Tweedie分布族分析RNA-seq数据
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionRNASeq测序软件StatisticalMethod
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.12.0)
进口 质量limma刨边机平行,cqn
链接
建议 tweeDEseqCountDataxtable
SystemRequirements
增强了
URL http://www.creal.cat/jrgonzalez/software.htm
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 tweeDEseq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 tweeDEseq_1.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) tweeDEseq_1.14.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) tweeDEseq_1.14.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/tweeDEseq/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tweeDEseq/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心