要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tweeDEseq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见tweeDEseq.
Bioconductor版本:3.1
利用Poisson-Tweedie分布族对RNA-seq进行差异表达分析。
作者:Juan R Gonzalez
维护者:Juan R Gonzalez
引文(从R内,输入引用(“tweeDEseq”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tweeDEseq”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“tweeDEseq”)
R脚本 | tweeDEseq:使用Poisson-Tweedie分布族分析RNA-seq数据 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.12.0) |
进口 | 质量,limma,刨边机平行,cqn |
链接 | |
建议 | tweeDEseqCountData,xtable |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.creal.cat/jrgonzalez/software.htm |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | tweeDEseq_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | tweeDEseq_1.14.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | tweeDEseq_1.14.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | tweeDEseq_1.14.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/tweeDEseq/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tweeDEseq/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |