安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“三”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅三人组。
Bioconductor版本:3.1
检测单核苷酸多态性和SNP基因型的交互的TDT。这个包此外包含函数计算成对值LD措施和确定LD街区,以及功能设置匹配情况下pseudo-control基因型数据case-parent三人小组为了运行三个逻辑回归,在三人小组将缺失的基因型,为模拟case-parent三人小组与疾病风险依赖SNP交互,对权力和样本量计算三个数据。
作者:Holger Schwender清丽,菲利普·伯杰,玛格丽特•陶布Christoph Neumann Ingo Ruczinski
维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >
从内部引用(R,回车引用(“三”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“三”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“三”)
R脚本 | 三个逻辑回归和基因型的TDT | |
参考手册 |
biocViews | GeneticVariability,遗传学,微阵列,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 3.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年) |
许可证 | LGPL-2 |
取决于 | R (> = 3.0.1) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生存,haplo.stats,mcbiopi,siggenes样条函数,LogicReg(> = 1.5.3)更正,logicFS(> = 1.28.1),KernSmooth,VariantAnnotation |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | trio_3.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | trio_3.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | trio_3.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | trio_3.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/trio/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/trio/ |
包下载报告 | 下载数据 |