# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tigre”)

这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tigre。

转录因子通过高斯过程推理重建的表达

Bioconductor版本:3.1

tigre包实现了我们的方法的高斯过程的微分方程模型来分析基因表达时间序列从单一输入主题网络。包可以用于推断未被注意的转录因子(TF)蛋白质浓度测量已知目标基因的表达,或候选人排名目标特遣部队。

作者:Antti Honkela,裴高,Jonatan Ropponen, Miika-Petteri Matikainen,马格努斯寻求资助,尼尔·d·劳伦斯

维护人员:Antti Honkela <管理。在hiit.fi honkela >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tigre”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tigre”)

PDF	R脚本	tigre快速指南
PDF	R脚本	tigre用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,GeneRegulation,微阵列,NetworkInference,软件,TimeCourse,转录
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 2.11.0),BiocGenerics,Biobase
进口	方法,AnnotationDbi,gplots、图表、数据、跑龙套,注释,DBI,RSQLite
链接
建议	drosgenome1.db,彪马,光民,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.manchester.ac.uk/resources/tiger/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	tigre_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	tigre_1.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	tigre_1.22.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	tigre_1.22.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/tigre/tree/release - 3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tigre/
包下载报告	下载数据