要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“shinyMethyl”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见shinyMethyl.
Bioconductor版本:3.1
交互式工具可视化Illumina的45万阵列数据
作者:Jean-Philippe Fortin [cre, aut], Kasper Daniel Hansen [aut]
维护者:Jean-Philippe Fortin
引文(从R内,输入引用(“shinyMethyl”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“shinyMethyl”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“shinyMethyl”)
R脚本 | shinyMethyl: Illumina 450K甲基化阵列的交互式可视化 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.9.1),minfi(> = 1.6.0),IlluminaHumanMethylation450kmanifest,matrixStats, r (>= 3.0.0) |
进口 | RColorBrewer |
链接 | |
建议 | shinyMethylData,minfiData,BiocStyle,RUnit,消化,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | shinyMethyl_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | shinyMethyl_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | shinyMethyl_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | shinyMethyl_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/shinyMethyl/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |