要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“scsR”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

scsR

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见scsR

SiRNA对种子脱靶效应的校正

Bioconductor版本:3.1

修正了全基因组siRNA筛选的种子介导脱靶效应。适合的功能,以识别有效的种子/ mirna和可视化他们的影响也提供在包。

作者:Andrea Franceschini

维护者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib。ch>, Roger Meier < Roger。Meier在lmsc.ethz。Christian von Mering in imls.uzh.ch>

引文(从R内,输入引用(“scsR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“scsR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“scsR”)

PDF R脚本 scsR装饰图案
PDF 参考手册

细节

biocViews 预处理软件
版本 1.4.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.14.0),STRINGdb、方法、BiocGenericsBiostringsIRangesplyr, tcltk
进口 sqldf哈希ggplot2,图形,grDevices,RColorBrewer
链接
建议 RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 scsR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 scsR_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) scsR_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) scsR_1.4.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/scsR/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scsR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心