要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ regionrereport”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

地区报告

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅地区报告

生成用于探索一组区域的HTML报告

生物导体版本:3.1

生成HTML报告以探索一组区域,例如在Derfinder执行的基本对分辨率下对RNA-Seq数据的注释 - 敏捷表达分析的结果。

作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE],Andrew E. Jaffe [AUT],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]

维护者:leonardo collado-torres

引用(从r内,输入引用(“区域报告”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ regionrereport”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ RegineReport”)

html R脚本 区域报告简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,差异性,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 1.2.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.2)
进口 Bumphunter(> = 1.7.6),德芬德(> = 1.1.0),derfinderplot(> = 1.1.0),DevTools(> = 1.6),GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,GGBIO(> = 1.13.13),GGPLOT2, 网格,栅格,,,,iranges,,,,编织(> = 1.0.1),尼特(> = 1.6),Knitrbootstrap(> = 0.9.0),MGCV,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown(> = 0.3.3),晶须
链接
建议 Biovizbase,,,,开罗,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/lcolladotor/regionreport
BugReports https://github.com/lcolladotor/regionreport/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 regionreport_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 regionreport_1.2.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) regionreport_1.2.1.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) regionreport_1.2.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/regionreport/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/regionreport/
软件包下载报告 下载统计

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