要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ regionrereport”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅地区报告。
生物导体版本:3.1
生成HTML报告以探索一组区域,例如在Derfinder执行的基本对分辨率下对RNA-Seq数据的注释 - 敏捷表达分析的结果。
作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE],Andrew E. Jaffe [AUT],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]
维护者:leonardo collado-torres
引用(从r内,输入引用(“区域报告”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ regionrereport”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RegineReport”)
html | R脚本 | 区域报告简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,差异性,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 1.2.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.2) |
进口 | Bumphunter(> = 1.7.6),德芬德(> = 1.1.0),derfinderplot(> = 1.1.0),DevTools(> = 1.6),GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,GGBIO(> = 1.13.13),GGPLOT2, 网格,栅格,,,,iranges,,,,编织(> = 1.0.1),尼特(> = 1.6),Knitrbootstrap(> = 0.9.0),MGCV,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown(> = 0.3.3),晶须 |
链接 | |
建议 | Biovizbase,,,,开罗,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/lcolladotor/regionreport |
BugReports | https://github.com/lcolladotor/regionreport/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | regionreport_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | regionreport_1.2.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | regionreport_1.2.1.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | regionreport_1.2.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/regionreport/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/regionreport/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |