要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rcellminer”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见rcellminer.
Bioconductor版本:3.1
几十年来,NCI-60癌细胞系面板一直被用作抗癌药物筛选。该小组是作为美国国家癌症研究所(NCI)的发育治疗计划(DTP, http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分而开发的。在NCI-60上已经测试了数千种化合物,这些化合物已被许多平台广泛表征为基因和蛋白质表达、拷贝数、突变等(Reinhold, et al., 2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)的目的是整合用于分析NCI-60的多个平台的数据,并为探索NCI-60数据提供一套强大的工具。
作者:Augustin Luna, Vinodh Rajapakse, Fabricio Sousa
维护者:Augustin Luna
引文(从R内,输入引用(“rcellminer”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rcellminer”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rcellminer”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用rcellminer |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,Cheminformatics,CopyNumberVariation,GeneExpression,遗传药理学,药物基因组学,软件,SystemsBiology,可视化,aCGH,microrna的 |
版本 | 1.0.1 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R (>= 3.1.1),Biobase,rcdk,指纹 |
进口 | stringr,gplots、方法、闪亮的 |
链接 | |
建议 | knitr,RColorBrewer,sqldf,BiocGenerics,testthat,rcellminerData,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://discover.nci.nih.gov/cellminer/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | rcellminerData |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | rcellminer_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | rcellminer_1.0.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | rcellminer_1.0.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | rcellminer_1.0.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/rcellminer/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rcellminer/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |