要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rcellminer”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

rcellminer

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见rcellminer

rcellminer: NCI-60细胞系的分子特征和药物反应

Bioconductor版本:3.1

几十年来,NCI-60癌细胞系面板一直被用作抗癌药物筛选。该小组是作为美国国家癌症研究所(NCI)的发育治疗计划(DTP, http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分而开发的。在NCI-60上已经测试了数千种化合物,这些化合物已被许多平台广泛表征为基因和蛋白质表达、拷贝数、突变等(Reinhold, et al., 2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)的目的是整合用于分析NCI-60的多个平台的数据,并为探索NCI-60数据提供一套强大的工具。

作者:Augustin Luna, Vinodh Rajapakse, Fabricio Sousa

维护者:Augustin Luna , Vinodh Rajapakse < Vinodh。Rajapakse在nih.gov>

引文(从R内,输入引用(“rcellminer”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rcellminer”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rcellminer”)

超文本标记语言 R脚本 使用rcellminer
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssaysCheminformaticsCopyNumberVariationGeneExpression遗传药理学药物基因组学软件SystemsBiology可视化aCGHmicrorna的
版本 1.0.1
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 LGPL-3
取决于 R (>= 3.1.1),Biobasercdk指纹
进口 stringrgplots、方法、闪亮的
链接
建议 knitrRColorBrewersqldfBiocGenericstestthatrcellminerDataBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://discover.nci.nih.gov/cellminer/
全靠我
进口我
建议我 rcellminerData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 rcellminer_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 rcellminer_1.0.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) rcellminer_1.0.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) rcellminer_1.0.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/rcellminer/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rcellminer/
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文档»

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支持»

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