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杂种

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅杂种

基于途径的数据集成OMIC数据

生物导体版本:3.1

PWOMICS基于基于预先分析的差异基因/转录本和蛋白质的用户指定列表的匹配OMIC数据集的基于途径的水平数据比较。对蛋白质组学数据的单独下游分析,包括途径识别和富集分析,转录因子鉴定和靶基因鉴定与从基因或转录信息开始的上游分析相反,作为鉴定上游转录因子和调节剂的基础。跨平台比较分析允许通过提供静态和动态分析工具进行数据集成来全面分析单个时间点实验和时间序列实验。

作者:Astrid Wachter

维护者:Astrid Wachter

引用(从r内,输入引用(“ pwomics”)):

安装

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文档

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PDF R脚本 杂种
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传学,,,,软件,,,,系统生物学,,,,转录
版本 1.1.8
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(1年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.2)
进口 Data.Table,,,,rbiopaxparser,,,,Igraph,,,,StringDB,图形,GPLOTS,,,,生物酶,,,,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,Biomart,,,,AnnotationHub,,,,基因组机
链接
建议 EBDBNET,,,,,,,,mfuzz
系统要求
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包源 pwomics_1.1.8.tar.gz
Windows二进制 pwomics_1.0.2.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) PWOMICS_1.1.8.TGZ
Mac OS X 10.9(Mavericks) PWOMICS_1.1.8.TGZ
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/pwomics/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pwomics/
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