要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("pvca")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

pvca

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pvca

主方差分量分析(PVCA)

Bioconductor版本:3.1

该包包含通过将混合模型(依赖于lme4包)中的所有“源”作为随机效应(包括双向交互项)拟合到从原始数据相关矩阵中获得的选定主成分,来评估批源的功能。此包随书“微阵列实验中的批处理效应和噪声,第12章”。

作者:Pierre Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>

维护人员:Jianying LI

引用(从R中,输入引用(pvca)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("pvca")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes (pvca)

PDF R脚本 微阵列数据的批处理效应估计
PDF 参考手册

细节

biocViews BatchEffect微阵列软件
版本 1.8.0
在Bioconductor公司 BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 2.15.1)
进口 矩阵Biobasevsnlme4
链接
建议 golubEsets
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 pvca_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 pvca_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) pvca_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) pvca_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/pvca/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/pvca/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心