要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("pvca")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pvca.
Bioconductor版本:3.1
该包包含通过将混合模型(依赖于lme4包)中的所有“源”作为随机效应(包括双向交互项)拟合到从原始数据相关矩阵中获得的选定主成分,来评估批源的功能。此包随书“微阵列实验中的批处理效应和噪声,第12章”。
作者:Pierre Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>
维护人员:Jianying LI
引用(从R中,输入引用(pvca)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("pvca")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes (pvca)
R脚本 | 微阵列数据的批处理效应估计 | |
参考手册 |
biocViews | BatchEffect,微阵列,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | LGPL (>= 2.0) |
取决于 | R (>= 2.15.1) |
进口 | 矩阵,Biobase,vsn,lme4 |
链接 | |
建议 | golubEsets |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | pvca_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | pvca_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | pvca_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | pvca_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/pvca/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pvca/ |
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