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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见oposSOM．

转录组数据综合分析

Bioconductor版本:3.1

该包将微阵列表达式数据转换为降维元数据。它提供了各种以样本为中心和以组为中心的可视化、样本相似性分析和功能丰富分析。底层SOM算法结合了特征聚类、多维缩放和降维，以及强大的可视化能力。它支持提取和描述数据中固有的函数表达式模块。

作者:Henry Wirth < Wirth at izbi. unil -leipzig.de>和Martin Kalcher

维护者:Henry Wirth < Wirth at izbi.uni-leipzig.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不受支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“oposSOM”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“oposSOM”)

PDF	R脚本	负鼠用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，软件，可视化
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.0)
进口	耶鲁大学管理学院，fastICA，scatterplot3d，象图，fdrtool，猿，igraph，KernSmooth平行,biomaRt，Biobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://som.izbi.uni-leipzig.de
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	oposSOM_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	oposSOM_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	oposSOM_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	oposSOM_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/oposSOM/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oposSOM/
软件包下载报告	下载数据