要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ neagui”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Neagui

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Neagui

进行网络富集分析(NEA)的R软件包。

生物导体版本:3.1

Neagui是一种易于使用的R软件包,以执行Alexeyenko等人提出的网络富集分析(NEA)。(2012)。NEA方法将GSEA中的重叠统计数据扩展到实验集中基因与功能类别中的网络链接,通过利用基因相互作用网络来利用生物学信息。NEAGUI需要以下r软件包:tcltk,kegg.db,go.db,reactome.db,org.hs.eg.db,AnnotationDBI和HWRITER。

作者:Setia Pramana,Woojoo Lee,Yudi Pawitan

维护者:setia pramana

引用(从r内,输入引用(“ Neagui”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ neagui”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Neagui”)

PDF R脚本 Neagui Vignette
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,,,,,GUI,,,,基因烯,,,,kegg,,,,微阵列,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,Reactome,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 GPL-2
要看 TCLTK
进口 HWRITER
链接
建议 AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,,,,kegg.db,,,,go.db,,,,Reactome.db,,,,运行,,,,gostats,,,,HWRITER
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 富集兄弟
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 neagui_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 neagui_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) neagui_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) neagui_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/neagui/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/neagui/
软件包下载报告 下载统计

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