要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ neagui”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Neagui。
生物导体版本:3.1
Neagui是一种易于使用的R软件包,以执行Alexeyenko等人提出的网络富集分析(NEA)。(2012)。NEA方法将GSEA中的重叠统计数据扩展到实验集中基因与功能类别中的网络链接,通过利用基因相互作用网络来利用生物学信息。NEAGUI需要以下r软件包:tcltk,kegg.db,go.db,reactome.db,org.hs.eg.db,AnnotationDBI和HWRITER。
作者:Setia Pramana,Woojoo Lee,Yudi Pawitan
维护者:setia pramana
引用(从r内,输入引用(“ Neagui”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ neagui”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Neagui”)
R脚本 | Neagui Vignette | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,去,,,,GUI,,,,基因烯,,,,kegg,,,,微阵列,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,Reactome,,,,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | TCLTK |
进口 | HWRITER |
链接 | |
建议 | AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,,,,kegg.db,,,,go.db,,,,Reactome.db,,,,运行,,,,gostats,,,,HWRITER |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 富集兄弟 |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | neagui_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | neagui_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | neagui_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | neagui_1.6.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/neagui/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/neagui/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |