要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ msa”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅MSA。
生物导体版本:3.1
该软件包为多个序列比对算法Clustalw,Clustalomega和Muscle提供了统一的R/Bioconductor界面。所有三种算法都集成在包装中,因此,它们不依赖任何外部软件工具,并且适用于所有主要平台。多个序列比对算法是通过使用乳胶包装TexShade贴印多个序列比对的函数来补充的。
作者:Enrico Bonatesta,Christoph Horejs-Kainrath,Ulrich Bodenhofer
维护者:ulrich bodenhofer
引用(从r内,输入引用(“ MSA”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ msa”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ MSA”)
R脚本 | MSA-用于多个序列对齐的R软件包 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,多重组合,,,,乘以quessequealignment,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.0.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(1年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.1.0),方法,生物弦(> = 2.30.0) |
进口 | RCPP(> = 0.11.1),生物基因,,,,iranges(> = 1.20.0),S4VECTORS, 工具 |
链接 | RCPP |
建议 | 生物酶,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.bioinf.jku.at/software/msa/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | msa_1.0.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | msa_1.0.2.2.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | msa_1.0.2.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | msa_1.0.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/msa/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msa/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |