要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ msa”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

MSA

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅MSA

多序列比对

生物导体版本:3.1

该软件包为多个序列比对算法Clustalw,Clustalomega和Muscle提供了统一的R/Bioconductor界面。所有三种算法都集成在包装中,因此,它们不依赖任何外部软件工具,并且适用于所有主要平台。多个序列比对算法是通过使用乳胶包装TexShade贴印多个序列比对的函数来补充的。

作者:Enrico Bonatesta,Christoph Horejs-Kainrath,Ulrich Bodenhofer

维护者:ulrich bodenhofer

引用(从r内,输入引用(“ MSA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ msa”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ MSA”)

PDF R脚本 MSA-用于多个序列对齐的R软件包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,多重组合,,,,乘以quessequealignment,,,,测序,,,,软件
版本 1.0.2
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(1年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.1.0),方法,生物弦(> = 2.30.0)
进口 RCPP(> = 0.11.1),生物基因,,,,iranges(> = 1.20.0),S4VECTORS, 工具
链接 RCPP
建议 生物酶,,,,尼特
系统要求
增强
URL http://www.bioinf.jku.at/software/msa/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 msa_1.0.2.2.tar.gz
Windows二进制 msa_1.0.2.2.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) msa_1.0.2.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) msa_1.0.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/msa/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/msa/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心