要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“马赛克”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见马赛克.
Bioconductor版本:3.1
这个包提供了拟合mosaic的函数,mosaic是一个统计框架,用于分析单样本或双样本ChIP-seq数据。
作者:钟东军,宽培芬,Sunduz Keles
维护人员:Chung Dongjun
引文(从R内,输入引用(“马赛克”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“马赛克”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“马赛克”)
R脚本 | 马赛克 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,ChIPseq,遗传学,测序,软件,转录 |
版本 | 2.2.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.0.0),方法,图形,Rcpp |
进口 | 质量样条函数,晶格,IRanges |
链接 | Rcpp |
建议 | mosaicsExample |
SystemRequirements | Perl |
增强了 | 平行 |
URL | http://groups.google.com/group/mosaics_user_group |
全靠我 | jmosaics |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | mosaics_2.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | mosaics_2.2.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | mosaics_2.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | mosaics_2.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/mosaics/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |