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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见missMethyl．

甲基化阵列数据分析

Bioconductor版本:3.1

Illumina公司Infinium HumanMethylation450阵列数据的差异变异性和差异甲基化的归一化和测试。归一化过程是数组内的子分位数归一化(SWAN)，它允许在单个数组上的Infinium I和II类型探针一起归一化。差异可变性的检验是基于Levene检验的经验贝叶斯版本。差异甲基化测试使用RUV进行，它可以通过使用负控制探针来调整高维数据中未知来源的系统误差。基因本体分析是通过考虑阵列上每个基因的探针数量来进行的。

作者:Belinda Phipson和Jovana Maksimovic

维护者:Belinda Phipson < Belinda。phipson at mcri.edu.au>， Jovana Maksimovic < Jovana。马克西莫维奇在McRi.edu.au >

安装

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文档

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browseVignettes(“missMethyl”)

PDF	R脚本	missMethyl:分析Illumina公司HumanMethylation450阵列的数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，DifferentialMethylation，GeneSetEnrichment，GeneticVariability，GenomicVariation，MethylationArray，归一化，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.3.0)
进口	limma，minfi，methylumi，IlluminaHumanMethylation450kmanifest，statmod，ruv，stringr，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，org.Hs.eg.db
链接
建议	minfiData，BiocStyle，knitr，刨边机，tweeDEseqCountData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	missMethyl_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	missMethyl_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	missMethyl_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	missMethyl_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/missMethyl/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/missMethyl/
软件包下载报告	下载数据