要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metaseqR”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

metaseqR

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见metaseqR

通过组合多种统计算法,用于RNA-Seq数据的分析和结果报告的R包。

Bioconductor版本:3.1

为RNA-Seq基因表达数据提供几个标准化和统计测试包的接口。此外,它还创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果进行元分析,并以交互式方式报告结果。

作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

维护者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

引文(从R内,输入引用(“metaseqR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metaseqR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“metaseqR”)

PDF R脚本 使用metaseqR的多种统计算法进行RNA-Seq数据分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression归一化预处理质量控制RNASeqReportWriting软件WorkflowStep
版本 1.8.1
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 2.13.0),EDASeqDESeqlimmaqvalue
进口 刨边机NOISeqbaySeqNBPSeqbiomaRt跑龙套,gplotscorrplotvsn酿造rjsonlog4r
链接
建议 BiocGenericsGenomicRangesrtracklayerRsamtoolssurvcomp维恩图knitr动物园RUnitBiocInstallerBSgenomeRSQLite
SystemRequirements
增强了 平行,移行细胞癌RMySQL
URL http://www.fleming.gr
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 metaseqR_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 metaseqR_1.8.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) metaseqR_1.8.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) metaseqR_1.8.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/metaseqR/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心