要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metaseqR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见metaseqR.
Bioconductor版本:3.1
为RNA-Seq基因表达数据提供几个标准化和统计测试包的接口。此外,它还创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果进行元分析,并以交互式方式报告结果。
作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
维护者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
引文(从R内,输入引用(“metaseqR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metaseqR”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“metaseqR”)
R脚本 | 使用metaseqR的多种统计算法进行RNA-Seq数据分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,ReportWriting,软件,WorkflowStep |
版本 | 1.8.1 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(2年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 2.13.0),EDASeq,DESeq,limma,qvalue |
进口 | 刨边机,NOISeq,baySeq,NBPSeq,biomaRt跑龙套,gplots,corrplot,vsn,酿造,rjson,log4r |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,GenomicRanges,rtracklayer,Rsamtools,survcomp,维恩图,knitr,动物园,RUnit,BiocInstaller,BSgenome,RSQLite |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行,移行细胞癌,RMySQL |
URL | http://www.fleming.gr |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | metaseqR_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | metaseqR_1.8.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | metaseqR_1.8.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | metaseqR_1.8.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/metaseqR/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |