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元基因组

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅元基因组

稀疏高通量测序的统计分析

生物导体版本:3.1

元基因组旨在确定两个或多个多个样品组之间差异丰富的特征(无论是操作性族群(OTU),物种等)。元基因组旨在解决微生物群落对疾病关联检测和特征相关测试的归一化和下采样的影响。

作者:Joseph Nathaniel Paulson,Hisham Talukder,Mihai Pop,Hector Corrada Bravo

维护者:Joseph N. Paulson

引用(从r内,输入引用(“元基因组”)):

安装

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文档

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BrowseVignettes(“ Metagenomeseq”)

PDF R脚本 Fittimeseries:通过时间或位置的差分丰度分析
PDF R脚本 元基因组:稀疏高通量测序的统计分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,差异性,,,,遗传因素,,,,宏基因组学,,,,微生物组,,,,多重组合,,,,正常化,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 艺术2.0
依靠 r(> = 3.0),生物酶,,,,林玛, 方法,rcolorbrewer
进口 平行,矩阵,,,,GPLOTS
链接
建议 注释,,,,生物基因,,,,Biom,,,,尼特,,,,GSS,,,,运行,,,,素食主义者,,,,InteractiveSplay
系统要求
增强
URL https://github.com/nosson/metagenomeseq/
BugReports https://github.com/nosson/metagenomeseq/issues
取决于我 MSD16S
进口我
建议我 InteractiveSplay
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 metagenomeseq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 metegenomeseq_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) metagenomeseq_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) metagenomeseq_1.10.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/metagenomeseq/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/metagenomeseq/
软件包下载报告 下载统计

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