要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("macat")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

macat

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见macat

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:3.1

该文库包含了研究差异基因表达和基因染色体定位之间的联系的函数。MACAT的动机是对肿瘤细胞中涉及大染色体区域的常见现象的观察。MACAT是一种用于识别显著差异表达的染色体区域的统计方法的实现。这些功能已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试,该数据集在“stjudem”图书馆中提供。

作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling

维护者:Joern Toedling

引用(从R中,输入引用(“macat”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("macat")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“macat”)

PDF R脚本 微阵列染色体分析工具
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression微阵列软件可视化
版本 1.42.0
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase注释
进口
链接
建议 hgu95av2.dbstjudem
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 macat_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 macat_1.42.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) macat_1.42.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) macat_1.42.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/macat/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心