要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Limma”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

林马

此包是Biocumonds 3.1版;对于稳定的最新版本版本,请参阅林马

微阵列数据的线性模型

Bioconductor版本:3.1

微阵列数据的数据分析,线性模型和差异表达。

作者:Gordon Smyth [Cre,Aut],Matthew Ritchie [CTB],Jeremy Silver [CTB],James Wettenhall [CTB],Natalie Thorne [CTB],Davis McCarthy [CTB],Di Wu [CTB],Yifang Hu [CTB],Wei Shi [CTB],Belinda Phiveon [CTB],Alicia Oshlack [CTB],Carolyn de Graf [CTB],Mette Langaas [CTB],Egil Ferkingstad [CTB],Marcus Davy [CTB],Francois Pepin [CTB],Dongseok Choi [CTB],Aaron Lun [CTB]

维护者:Gordon Smyth

引文(从R内,输入引文(“Limma”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Limma”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“LIMMA”)

PDF. r script. 林马一页介绍
PDF. Usersguide.pdf.pdf.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 替代品batcheffect.贝叶斯聚类DataImport.不同的亚兴差异化Exonarray.基因表达GenesetenRichment.遗传学微阵列多匹匹莫森正常化oneChannel.预处理proprietaryplatforms.QualityControl.rnaseq.回归软件时间课程转录两种通道MRAMICRARARAY.microRNAARRAY.
版本 3.24.15
在生物导体中以来 BIOC 1.6(R-2.1)或更早版本(> 11年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 R(> = 2.3.0),方法
进口
链接到
建议 敬服annotationdbi.百瑞德BioBase.椭圆go.db.Illuminaio.凯格斯特Locfit.大量的org.hs.eg.db.,花键,Statmod.(> = 1.2.2),VSN.
系统要求
加强
URL. http://bioinf.wehi.edu.au/limma.
取决于我 A4Base.yeasyExpressAgimicrorna.吸引比希拉索布尔CCL4.CGHMCR.chimphumanbraindata.Clippda.Codelink.兑换cormotif玉石困惑dmrcate.药物潜行酶edger.eximir.FEMfletcher2013a.GCMAP.HD2013SGI.htqpcr.maigespack.mapredictdsc.马拉莱MetagenomeSQ.metaseqr.MLSEQ.mmpalatemirna.PROT2D.QPcrnorm.QUusage.rbm.林诺rnbeads.rnits.snapcgh.SSPA.翻译马托姆大陆西瓜
进口我 ABSSEQ.倍感工具聘请圭圭ArrayExpress.ressquality.ArrayqualityMetrics.ArrayTools.吸引舞会礼服Beadarraybeadarrayusecases.赌注BIRTE.Bumphunter.索布尔癌变分析卡斯珀冠军魅力Chippeakanno.Compcoder.CSAW.Diffhic.Dmelsgi.enrichmentbrowser.erccdashboard.探索酶流动geneselectmmd.Geneselector.GGBase.Gosummaries.gqtlstats.htqpcr.ichip.inpas.Limmagui.lmdme.lvsmirnamapkl.masigpro.Minfi.MissMethyl.mmpalatemirna.单片MSSTATS.NEM.罚款奥林PAA.牧伙伴佩奇百事可乐现象聚酯纤维ReportingTools.林诺rnainteract.rnaityrtn.rtoppersimbindprofiles.snapcgh.议案Systempiper.时间课程Topaseq.TweedeSeQ.VSN.
建议我 abarray.AdacGH2.beadarraysnp.Bioccasestudies.二乙衫类别CompoundationCompare.classifyr.CMA.COGPS.染料纤维弯头Geneselector.地理曲线GSRI.GSVA.散热InsilicodB.等待者llumi.mammaprintdata.MDGSA.弥撒MLP.NPGSEA.oligo.onechannelgui.paxtoolsr.PGSEA钢琴PLW.预先彪马rcade.rtopperrtracklayer.七百年人SVA.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 limma_3.24.15.tar.gz.
Windows二进制文件 limma_3.24.15.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹) limma_3.24.15.tgz.
Mac OS x 10.9(mavericks) limma_3.24.15.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/limma/tree/release-3.1
包短网址 http://biocidodder.org/packages/limma/
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