##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“h5vc”)

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见h5vc．

使用hdf5后端管理对齐计数

Bioconductor版本:3.1

这个包包含与存储在HDF5文件中的NGS实验数据交互的函数。详情请参见http://www.ebi.ac.uk/~pyl/h5vc的网页。

作者:Paul Theodor Pyl

维护者:Paul Theodor Pyl < Pyl at embl.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“h5vc”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“h5vc”)

超文本标记语言	R脚本	用h5vc和shiny构建最小基因组浏览器
超文本标记语言	R脚本	h5vc—旅游
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	2.2.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	网格,gridExtra，ggplot2
进口	rhdf5，重塑，S4Vectors，IRanges，Biostrings，Rsamtools(>= 1.19.38)，方法GenomicRanges，abind，BiocParallel，BatchJobs，h5vcData，GenomeInfoDb
链接	Rsamtools
建议	knitr，locfit，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，bit64，biomaRt，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	h5vcData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	h5vc_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	h5vc_2.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	h5vc_2.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	h5vc_2.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/h5vc/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/h5vc/
软件包下载报告	下载数据