要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gtrellis”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

gtrellis

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见gtrellis

基因组级网格布局

Bioconductor版本:3.1

基因组水平格状图以基因组类别(例如染色体)为条件可视化基因组数据。对于每个基因组类别,以轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。该软件包提供了高度的灵活性来安排基因组类别,并在图中添加自定义的图形。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

引文(从R内,输入引用(“gtrellis”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gtrellis”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“gtrellis”)

超文本标记语言 R脚本 制作基因组水平格子图
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 测序软件可视化
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.1.0),网格
进口 circlize(> = 0.2.3),GetoptLong
链接
建议 testthat(> = 0.3),knitrGenomicRangesRColorBrewer减价
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jokergoo/gtrellis
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 gtrellis_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 gtrellis_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) gtrellis_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) gtrellis_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/gtrellis/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心