要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gtrellis”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见gtrellis.
Bioconductor版本:3.1
基因组水平格状图以基因组类别(例如染色体)为条件可视化基因组数据。对于每个基因组类别,以轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。该软件包提供了高度的灵活性来安排基因组类别,并在图中添加自定义的图形。
作者:顾祖光
维护者:祖光谷
引文(从R内,输入引用(“gtrellis”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gtrellis”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“gtrellis”)
超文本标记语言 | R脚本 | 制作基因组水平格子图 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 测序,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.1.0),网格 |
进口 | circlize(> = 0.2.3),GetoptLong |
链接 | |
建议 | testthat(> = 0.3),knitr,GenomicRanges,RColorBrewer,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jokergoo/gtrellis |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | gtrellis_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | gtrellis_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | gtrellis_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | gtrellis_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/gtrellis/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |