要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“groHMM”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见groHMM.
Bioconductor版本:3.1
用于分析GRO-seq数据的管道。
作者:Charles G. Danko, Minho Chae, Andre Martins, W. Lee Kraus
维护者:Anusha Nagari< Anusha。nagari at utsouthwest .edu>, W. Lee Kraus < Lee . Kraus at utsouthwest .edu>
引文(从R内,输入引用(“groHMM”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“groHMM”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“groHMM”)
R脚本 | groHMM教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 测序,软件 |
版本 | 1.3.1 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.0.2),质量,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,rtracklayer、并行 |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,GenomicFeatures,刨边机,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | groHMM_1.3.1.tar.gz |
Windows二进制 | groHMM_1.3.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | groHMM_1.3.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | groHMM_1.3.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/groHMM/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/groHMM/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |