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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genoset。

提供类类似于ExpressionSet拷贝数分析

Bioconductor版本:3.1

负荷、操作和情节copynumber和BAF数据。GenoSet类扩展eSet通过添加“locData”农庄组织对象。这个对象包含功能基因组位置数据和提供有效的构造子集在基因组的位置。提供便利的函数进行处理的拷贝数和b频率数据。提供的类RleDataFrame存储运行数据以及多个样本的基因组。

作者:彼得·m·哈

维修工:彼得·m·哈< phaverty gene.com >

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PDF	R脚本	genoset
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DataRepresentation,基础设施,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),BiocGenerics(> = 0.11.3),Biobase(> = 2.15.1),GenomicRanges(> = 1.17.19)
进口	S4Vectors(> = 0.2.3),GenomeInfoDb(> = 1.1.3),IRanges、方法、图形
链接
建议	RUnit,DNAcopy统计数据,BSgenome,Biostrings
SystemRequirements
增强了	平行
URL	https://github.com/phaverty/genoset
取决于我	VegaMC
进口我	methyAnalysis
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	genoset_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	genoset_1.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	genoset_1.22.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	genoset_1.22.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/genoset/tree/release - 3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genoset/
包下载报告	下载数据