安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“genefilter”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genefilter。
Bioconductor版本:3.1
一些基本的功能筛选基因
作者:r .绅士,诉凯利,w·胡贝尔Hahne
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“genefilter”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“genefilter”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“genefilter”)
R脚本 | 增加额外的情节:独立的过滤能力检测差异表达基因,Bourgon et al ., PNAS (2010) | |
R脚本 | 诊断为独立的过滤 | |
R脚本 | 如何找到类似于指定基因的表达谱的基因吗 | |
R脚本 | 使用genefilter函数过滤基因微阵列数据集 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.50.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | AnnotationDbi,注释,Biobase、图形、方法、统计数据生存 |
链接 | |
建议 | 类,hgu95av2.db,tkWidgets,所有,中华民国,DESeq,pasilla,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | a4Base,ampliQueso,cellHTS,cellHTS2,魅力,CNTools,GeneMeta,Hiiragi2013,simpleaffy,股东价值分析 |
进口我 | affyQCReport,annmap,arrayQualityMetrics,类别,DESeq,DESeq2,DEXSeq,eisa,gCMAP,GGBase,GSRI,methyAnalysis,methylumi,minfi,MLInterfaces,mogsa,PECA,phenoTest,林格,RNAinteractMAPK,simpleaffy,tilingArray,XDE |
建议我 | AffyExpress,注释,ArrayTools,BiocCaseStudies,生命网络,类别,categoryCompare,clusterStab,codelink,compcodeR,curatedBladderData,curatedCRCData,curatedOvarianData,雌激素,factDesign,ffpe,ffpeExampleData,gageData,GenomicFiles,GOstats,GSAR,GSEAlm,GSVA,logicFS,光民,MAQCsubset,MCRestimate,npGSEA,益生元,oneChannelGUI,phyloseq,pvac,qpgraph,rheumaticConditionWOLLBOLD,rtracklayer,siggenes,SSPA,topGO,XDE |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | genefilter_1.50.0.tar.gz |
Windows二进制 | genefilter_1.50.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | genefilter_1.50.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | genefilter_1.50.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/genefilter/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/ |
包下载报告 | 下载数据 |