安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“genefilter”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

genefilter

这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genefilter

genefilter:筛选基因高通量实验的方法

Bioconductor版本:3.1

一些基本的功能筛选基因

作者:r .绅士,诉凯利,w·胡贝尔Hahne

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(“genefilter”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“genefilter”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genefilter”)

PDF R脚本 增加额外的情节:独立的过滤能力检测差异表达基因,Bourgon et al ., PNAS (2010)
PDF R脚本 诊断为独立的过滤
PDF R脚本 如何找到类似于指定基因的表达谱的基因吗
PDF R脚本 使用genefilter函数过滤基因微阵列数据集
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,软件
版本 1.50.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 AnnotationDbi,注释,Biobase、图形、方法、统计数据生存
链接
建议 ,hgu95av2.db,tkWidgets,所有,中华民国,DESeq,pasilla,BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 a4Base,ampliQueso,cellHTS,cellHTS2,魅力,CNTools,GeneMeta,Hiiragi2013,simpleaffy,股东价值分析
进口我 affyQCReport,annmap,arrayQualityMetrics,类别,DESeq,DESeq2,DEXSeq,eisa,gCMAP,GGBase,GSRI,methyAnalysis,methylumi,minfi,MLInterfaces,mogsa,PECA,phenoTest,林格,RNAinteractMAPK,simpleaffy,tilingArray,XDE
建议我 AffyExpress,注释,ArrayTools,BiocCaseStudies,生命网络,类别,categoryCompare,clusterStab,codelink,compcodeR,curatedBladderData,curatedCRCData,curatedOvarianData,雌激素,factDesign,ffpe,ffpeExampleData,gageData,GenomicFiles,GOstats,GSAR,GSEAlm,GSVA,logicFS,光民,MAQCsubset,MCRestimate,npGSEA,益生元,oneChannelGUI,phyloseq,pvac,qpgraph,rheumaticConditionWOLLBOLD,rtracklayer,siggenes,SSPA,topGO,XDE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 genefilter_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 genefilter_1.50.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) genefilter_1.50.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) genefilter_1.50.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/genefilter/tree/release - 3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心