##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“geneRxCluster”)

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见geneRxCluster。

gRx微分集群

Bioconductor版本:3.1

检测基因组位点的差异聚类，如基因治疗整合。该包提供了一些功能，用于探索来自两个不同来源的基因组插入位点。这两种来源可能是两种不同的基因治疗载体。向量的优先目标敏感区域较少，激励搜索局部簇插入和比较由不同向量的积分形成的簇。扫描统计允许发现聚类中的空间差异，并计算错误发现率(FDRs)，为比较逆转录病毒载体提供统计方法。本文实现了一种用于比较两个向量的扫描统计量，利用多个窗宽检测聚类差异并计算FDRs。

作者:查尔斯·贝瑞

维护者:Charles Berry

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“geneRxCluster”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“geneRxCluster”)

PDF	R脚本	使用geneRxCluster
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,遗传学,测序,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	GenomicRanges,IRanges
进口
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	geneRxCluster_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	geneRxCluster_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)	geneRxCluster_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	geneRxCluster_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/geneRxCluster/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geneRxCluster/
包下载报告	下载数据