要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gQTLstats”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见gQTLstats.
Bioconductor版本:3.1
eQTL、mQTL、dsQTL等的计算效率分析。
作者:VJ Carey
维护者:VJ Carey
引文(从R内,输入引用(“gQTLstats”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gQTLstats”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“gQTLstats”)
超文本标记语言 | R脚本 | gQTLstats:基因组特征的遗传统计 |
参考手册 |
biocViews | 软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.1.0) |
进口 | snpStats,GenomicRanges,VariantAnnotation、方法、Biobase,BatchJobs,gQTLBase,GenomeInfoDb,S4Vectors,limma,BiocGenerics,gam,dplyr,AnnotationDbi,IRanges,GenomicFeatures,ggplot2,reshape2,doParallel,foreach |
链接 | |
建议 | geuvPack,geuvStore,Rsamtools,knitr,rmarkdown,ggbio,BiocStyle,Homo.sapiens |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | gwascat |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | gQTLstats_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | gQTLstats_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | gQTLstats_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | gQTLstats_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/gQTLstats/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gQTLstats/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |