要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“fmcsR”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

fmcsR

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见fmcsR

错配容忍度最大公共子结构搜索

Bioconductor版本:3.1

fmcsR包引入了一种高效的最大公共子结构(MCS)算法,结合了一种新颖的匹配策略,允许两个小分子共享的子结构中的原子和/或键不匹配。由此产生的柔性MCSs (FMCSs)通常比严格的MCSs更大,从而在其源结构中识别更多的共同特征,以及在寻找结构相似性较弱的化合物时具有更高的灵敏度。fmcsR包提供了几个实用程序来使用FMCS算法进行成对复合比较、结构相似性搜索和聚类。

作者:王燕,泰勒·贝克曼,凯文·霍兰,托马斯·格克

维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>

引文(从R内,输入引用(“fmcsR”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“fmcsR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“fmcsR”)

超文本标记语言 R脚本 fmcsR
PDF 参考手册
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文本 新闻

细节

biocViews BiomedicalInformaticsCellBasedAssaysCheminformatics聚类DataImport基础设施MicrotitrePlateAssay遗传药理学药物基因组学蛋白质组学软件可视化
版本 1.10.3
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10.0),ChemmineR、方法
进口 RUnit、方法、ChemmineRBiocGenerics、并行
链接
建议 BiocStyleknitrknitcitationsknitrBootstrap
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/girke-lab/fmcsR
全靠我
进口我 Rcpi
建议我 ChemmineR
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 fmcsR_1.10.3.tar.gz
Windows二进制 fmcsR_1.10.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) fmcsR_1.10.3.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) fmcsR_1.10.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/fmcsR/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fmcsR/
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文档»

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