##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flipflop”)

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见啪嗒啪嗒地响．

基于套索的异构体快速预测作为流动问题

Bioconductor版本:3.1

Flipflop根据RNA-Seq读取数据，发现在给定样本中表达的基因亚型及其丰度。它接受SAM格式的对齐文件作为输入。它还可以同时发现来自多个样本的转录本，增加统计能力。

作者:Elsa Bernard, Laurent Jacob, Julien Mairal, Jean-Philippe Vert

维护者:Elsa Bernard < Elsa。Bernard在mines-paristech.fr>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flipflop”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“触发器”)

PDF	R脚本	FlipFlop:基于套索的快速异型预测流问题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，RNASeq，RNASeqData，回归，软件
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)
进口	方法,矩阵，IRanges，GenomicRanges、并行
链接
建议	GenomicFeatures
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	http://cbio.ensmp.fr/flipflop
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	flipflop_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	flipflop_1.6.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	flipflop_1.6.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	flipflop_1.6.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/flipflop/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flipflop/
软件包下载报告	下载数据