要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ epigenomix”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Epgenomix

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Epgenomix

表观遗传和基因转录数据归一化以及与混合模型的整合

生物导体版本:3.1

通过ChIP-Seq获得的基于RNA-SEQ或微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的集成分析的包装。该软件包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及适合贝叶斯混合模型的方法,以检测两种数据类型差异的基因。

作者:汉斯·乌尔里希·克莱因(Hans-Ulrich Klein),马丁·谢弗(Martin Schaefer)

维护者:hans-ulrich klein

引用(从r内,输入引用(“ Epegenomix”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ epigenomix”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Epegenomix”)

PDF R脚本 Epigenomix软件包小插图
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,分类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 LGPL-3
要看 r(> = 2.12.0),方法,生物酶,,,,iranges,,,,基因组机
进口 生物基因,,,,rsamtools,,,,Beadarray
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 epigenomix_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 epigenomix_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) Epigenomix_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) Epigenomix_1.8.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/epigenomix/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/epigenomix/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心