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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见ensemblVEP．

集成变异效应预测器的R接口

Bioconductor版本:3.1

通过perl API查询ensemble Variant Effect Predictor

作者:Valerie Obenchain < vbencha at fhcrc.org>，

维护者:Valerie Obenchain < vbencha at fhcrc.org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ensemble blvep”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ensemblVEP”)

PDF	R脚本	ensemblVEP
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	注释，单核苷酸多态性，软件，VariantAnnotation
版本	1.8.1
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics，GenomicRanges，VariantAnnotation
进口	Biostrings
链接
建议	RUnit
SystemRequirements	必须安装Ensembl VEP (API版本80)和Perl包DBD::mysql。有关安装说明，请参阅README软件包和Ensembl网站http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/index.html。
增强了
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ensemblVEP_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	ensemblVEP_1.8.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ensemblVEP_1.8.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	ensemblVEP_1.8.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ensemblVEP/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ensemblVEP/
软件包下载报告	下载数据