要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见eisa.
Bioconductor版本:3.1
迭代签名算法(ISA)是一种聚类方法;它在基因表达(或其他表格)数据中找到相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠模块,并具有抗噪声能力。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准的BioConductor数据结构;并且还包含了各种可视化工具,可以与其他双聚类算法一起使用。
作者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>
维护者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(eisa)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (eisa)
R脚本 | eisa和biclust套餐 | |
R脚本 | 基因表达数据的迭代签名算法 | |
参考手册 |
biocViews | 分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | isa2,Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法 |
进口 | BiocGenerics,类别,genefilter,DBI |
链接 | |
建议 | igraph(> = 0.6),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | ExpressionView |
进口我 | ExpressionView |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | eisa_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | eisa_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | eisa_1.20.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | eisa_1.20.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/eisa/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |