要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

eisa

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见eisa

通过迭代签名算法进行表达式数据分析

Bioconductor版本:3.1

迭代签名算法(ISA)是一种聚类方法;它在基因表达(或其他表格)数据中找到相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠模块,并具有抗噪声能力。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准的BioConductor数据结构;并且还包含了各种可视化工具,可以与其他双聚类算法一起使用。

作者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>

维护者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(eisa)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (eisa)

PDF R脚本 eisa和biclust套餐
PDF R脚本 基因表达数据的迭代签名算法
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类GeneExpression微阵列软件可视化
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 isa2Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法
进口 BiocGenerics类别genefilterDBI
链接
建议 igraph(> = 0.6),矩阵GOstatsGO.dbKEGG.dbbiclust质量xtable所有hgu95av2.dbtargetscan.Hs.eg.dborg.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 ExpressionView
进口我 ExpressionView
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 eisa_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 eisa_1.20.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) eisa_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) eisa_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/eisa/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
软件包下载报告 下载数据

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支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心