要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("dyebias")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

dyebias

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见dyebias

用于校正滑动依赖基因特异性染料偏倚的GASSCO方法

Bioconductor版本:3.1

许多双色杂交受到基因特异性和切片特异性染料偏倚的影响。前者取决于用于标记的核苷酸的含量;后者取决于贴标签的百分比。到目前为止,幻灯片依赖性还没有被认识到,这使得处理人工制品成为不可能。给定合理数量的染料交换杂交对,或相同对相同杂交对,基因偏差和滑动偏差都可以用GASSCO方法估计和修正(Margaritis等,Mol. Sys.)。生物学:266 (2009),doi:10.1038/msb.2009.21)

作者:Philip Lijnzaad和Thanasis Margaritis

维护者:Philip Lijnzaad

引用(从R中,输入引用(“dyebias”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("dyebias")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“dyebias”)

PDF R脚本 染料偏差纠正
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews 微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 1.4.1),marrayBiobase
进口
链接
建议 limma转换GEOquerydyebiasexamples、方法
SystemRequirements
增强了
URL http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad
取决于我
进口我
建议我 dyebiasexamples
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 dyebias_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 dyebias_1.26.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) dyebias_1.26.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) dyebias_1.26.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/dyebias/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心