要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("dyebias")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见dyebias.
Bioconductor版本:3.1
许多双色杂交受到基因特异性和切片特异性染料偏倚的影响。前者取决于用于标记的核苷酸的含量;后者取决于贴标签的百分比。到目前为止,幻灯片依赖性还没有被认识到,这使得处理人工制品成为不可能。给定合理数量的染料交换杂交对,或相同对相同杂交对,基因偏差和滑动偏差都可以用GASSCO方法估计和修正(Margaritis等,Mol. Sys.)。生物学:266 (2009),doi:10.1038/msb.2009.21)
作者:Philip Lijnzaad和Thanasis Margaritis
维护者:Philip Lijnzaad
引用(从R中,输入引用(“dyebias”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("dyebias")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“dyebias”)
R脚本 | 染料偏差纠正 | |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | 微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.4 (R-2.9)(7年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 1.4.1),marray,Biobase |
进口 | |
链接 | |
建议 | limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | dyebiasexamples |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | dyebias_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | dyebias_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | dyebias_1.26.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | dyebias_1.26.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/dyebias/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/ |
包下载报告 | 下载数据 |